رحم کیسه ای سه لایی است که جنین در آن به سر می برد و جنین به وسیله جفت مواد غذایی مورد نیاز کودک را برای او می فرستد و مواد زاید دفعی را از بدن کودک می گیرد.تغذیه جنین در دوران بارداری از طریق خونی که از رحم به بافت جفت می رود انجام می گیرد.جفت شامل یک شبکه عروقی خونی است این بافت از طریق رگ های خونی به رحم متصل است و مواد غذایی را به جنین می رساند و مواد دفعی را از جنین می گیرد.

درحقیقت جفت کار کلیه و کبد و دستگاه گوارش و ریه را برای جنین انجام می‌دهد و همچنین جفت جنین را از ابتلا به بعضی عفونتهایی که مادر اتفاقا بدان مبتلا می‌شود، حفظ می‌کند.و عملکرد جفت یکی از معجزات خلقت می باشد.

در سوره رعد آیه 8 به این خاصیت رحم اشاره شده است:

خدا مى‏داند آنچه را که هر ماده‏اى [در رحم] بار مى‏گیرد و [نیز] آنچه را که رحمها مى‏کاهند و آنچه را مى‏افزایند و هر چیزى نزد او اندازه‏اى دارد.

در زمان پیامبر اکرم (ص) مردم می دانستند که جفت نقش تغذیه جنین را بر
عهده دارد اما از اینکه مواد دفعی جنین توسط رحم پس گرفته می شود اطلاعی در دست نبود و بخش دوم آیه اعجاز علمی برای قرآن محسوب می شود.

نکته برخی از دوستان اتئیست در سایتها مختلف معنی این آیه را بصورت زیر می نویسند:

و تنهاخدا مى‏داند آنچه را که هر ماده‏اى ...

و می نویسند اگر تنها خدا می داند پس این دستگاهای رادیولوژی چیست و ...؟

در جواب این دوستان باید گفت که: 
ترجمه ارائه شده توسط برخی از دوستان اشتباه است و ترجمه ی واژه ی تنها در عربی ""فقط"" است در حالی که کلمه ی فقط در این آیات نیامده است.برای مشاهده ترجمه واقعی می توانید سایت پارس قرآن را نیز چک کنید.

حتی اگر هم ترجمه ارائه شده توسط شما ترجمه صحیح باشد یکی از دوستان نیز در جایی به این نکته اشاره کرده بودند:

قبل از ترکیب اسژرم و تخمک هیچ کسی از این که نتیجه (چه از نظر جنسیتو چه از نظرخصوصیات) چه در خواهد آمد, ندارد و با هیچ وسیله و تکنولوژی ای هم
قابل تشخیصنیست.تنها پس از لقاح و ترکیب آن دو میتوان نتیجه را بررسی کرد.ممکن
است حدس ها واحتمالاتی راجع به جنسیت و یا خصوصیات نطفه حاصل شده(قبل از لقاح) ازطریق بررسی سابقه فامیلی و ژنتیک زده شود ولی هیچ کدام قطعی نیست و در بسیاری موارد اشتباه ازآب در می آید.هنگام تشکیل نطفه 50 درصد ممکن است دختر باشد 50 درصدممکن است پسرباشد سایر خصوصیات و کدهای ژنتیکی نیز به همینطور اند.

DNA ها یا دئوکسی‌ریبونوکلئیک‌اسید  واحد هایی در مرکز هر سلول هستندکه حاوی اطلاعات ژنتیکی سلول ها هستند و در مرکز سلول ها وجود دارند و سلول با
استفاده از اطلاعات DNA  به ادامه فعالیت های خود می پرزد.

DNA هاساختار پروتئینی دارند و حاوی ژن ها هستنداز لحاظ شیمیایی نیز DNA  پلی مریطولانی با واحد هایی نوکلئوتیدی است و با اتصال ستون هایی از فسفات تشکیل شده است.
یک مولکول DNA  ممکن است از میلیون هانوکلئوتید تشکیل شده باشد.و مانند نردبان پیچ خورده ای است که به وسیله بازها به هم متصل شده است.

ساختار DNA  توسط فرانسیس کریک و جیمزواتسون در سال 1953 کشف شد و این دو در سال 1962 به خاطر این کشف موفق به دریافتجایزه نوبل شدند.

سلول بدون DNA هیچ عملکردی ندارد و عملا مرده است در سوره انبیا آیه 37 به این موضوع اشاره شده است:

«انـسان از  عَـجَـل  آفریده شده است. آیات خود را "درآینده" به شما نشان خواهم داد. بنابـر ایـن بیتابی نکنید».

نکته جالبی که در پس از آن نوشته است که در آینده نشانه هایخود را برای شما نشان خواهیم داد و در این آینه نوشته شده است که بزودی این مسالهکشف خواهد شد و این قسمت احتمال اینکه این آیه در مورد DNA  صدق کند را افزایش می دهد.

دوستانی که در دبیرستان رشته تجربی درس خوانده باشند یا مسائل مرتبط با ژنتیک را حل کرده باشند از این موضوع آگاهی دارند که در آمیزش بین زن مرد ژن های مرد به صورت XY  و ژن های زن بصورت XX  است که شامل 23 جفت کروموزوم غیر جنسی و یک جفت کروموزوم جنسی است و در هنگامی که قرار است نطفه تشکیل شود یک کروزوم از زن و یک کروموزوم از مرد برای تعین جنسیت جنین وارد می شود یعنی کسی که کروموزم X  از مرد وارد شود فرزند حتما دختر خواهد بود و اگر Y  وارد شود فرزند پسر خواهد بود البته گاهی اختلالاتی نیز در این فرآیند انجام می شود که منجر به بروز افراد دو جنسیتی و یا صفات مردانه و زنانه در زنان و مردان می شود.

با مشاهده کروموزم XY  می بینیم که کروموزوم مرد شامل کروموزوم های هم مرد Y و X و هم شامل کروموزم های زن که X است می باشد.

در سوره قیامت آیه 37- 39 به این مطلب اشاره شده است:

ا او نطفه‏اى از منى که در رحم ریخته مى‏شود نبود سپس بصورت خون‏بسته در آمد و خداوند او را آفرید و موزون ساخت و از او دو زوج مرد و زن آفرید.

همچنین اگر دقت کنید می بینید که شخصی که کرومزوم y  داشته باشد مرد است و مرد کروموزوم Y  را وارد چرخه می کند پس عامل موثر در تعین جنسیت مرد است زیرا اگر X  بدهد فرزند دختر و اگر Y  بدهد فرزند پسر می شود در زمانهای گذشته حتی تا قبل از بوجود آمدن علم ژنتیک تصور بر این بود که زن جنسیت جنین را تعین می کند ولی در قرآن کریم به طور غیر مستقیم نکته این مساله در آیه بالا اشاره شده است.

دکتر کیت مور می نویسد :در طول رشد چشمها بعد از آنکه گوش درونی ظاهر شدشروع به رشد می کنند او در ادامه می افزاید مغز مرکز احساس و درک پس از چشم وگوش آغاز به رشد می کند.

گوش های جنین در بتدای بیست و دوروز اول حاملگی ظاهر می شوند و تا ماه چهارم شروع به کار می کنند در این زمان جنین قادر است در رحم صداها را بشنود به همین دلیل برای نوزاد تازه متولد شده حس شنوایی بیش از سایر کار کردهای حیاتی شکل می گیرد.

مراحل کلی شکلگیری جنین بصورت خلاصه به این صورت است:

در مدت سه تا 4 روز بعد از لقاح سلول اولیه به صورت یک شکل کروی در می آید در روز 4-5 در داخل سلول بصورت بلاستوسیت در می آید و حفره ای در آن ایجاد می شود در هفته دوم اکتودرم که منشا مغز نخا عصب ها پوست خان و موست تشکیل می شود.

در هفته سوم مغز به سه قسمت اصلی جلویی میانی و عقبی تشکیل می شود و قلب شروع به تپیدن می کند.

در بین هفته 3-4 مغز و نخا و قلب جنین در به راحتی شناخته می شود از روز 28 به بعد چشمها گوشها و سیستم تنفسی شروع به شکلگیری می کنند و از روز 42 به بعد اسکلت بدن کامل می شود

در هفته پنجم دستها و پاها و چشمها شروع به رشد می کنند و از هفته هفتم پلکها و انگشت ها شکل می گیرند و بینی متمایز می شود در هفته هشتم تمام سیستم های بدن شکل می گیرد و ناخنها شروع به رشد می کند.

در هفته یازدهم جنین شروع به تنفس می کند در هفته نهم اثر انگشت شکل می گیرد و کف دست حساس به لمس می شود.

پس از 14 هفته جنین قادر به شنیدن می باشد و در هقته 26 جنین به صداها واکنش نشان می دهد.در هفته بیستم جنین درد را حس می کند و در شش ماهگی تبدیل به یک انسان کامل می شود.

در سوره مومنون آیات 12-14 نوشته شده است

و به یقین انسان را از عصاره‏اى از گل آفریدیم (۱۲)سپس او رانطفه‏اى درجایگاهى استوار قرار دادیم (۱۳)آنگاه نطفه را به صورت علقه درآوردیم پس آن علقه را مضغه گردانیدیم و آنگاه مضغه را استخوانهایى ساختیم بعد استخوانها را با گوشتى پوشانیدیم آنگاه آفرینشى دیگر پدید آوردیم آفرین باد بر خدا که بهترین آفرینندگان است (۱۴)

همانگونه که در قرآن شرح داده شده است بعد از لقاح جنین جنین ابتدا بصورت یک قطعه گشت در می آید و سپس استخوانها تشکیل می شود و در مراحل بعد که درقرآن به آن عنوان آفریتش دیگر یاد شده چشمها دست ها عصب قلب و ... پدید می آیند
مساله جالب این است که در زمانهای قدیم تصور به این صورت بود که ابتدا استخوان ها تشکیل می شود و سپس گوشت به دور آن تشکیل می شود اما قرآن در 1400 سال قبل که هیچ دستگاه رادیولوژی وجود نداشت از این نکته اشاره کرده است.هم چنین قرآن به علقه اشاره کرده که علقه در عربی گاهی اوقات به معنای جسم آویزان است و گاهی به معنای زالو که کاملا تعبیری درستی است در مراحل اولیه جنین به این صورت از دیواره رحم آویزان می شود.و شکلی مثل زالو را دارد.

یَا أَیُّهَا الْإِنسَانُ مَا غَرَّکَ بِرَبِّکَ الْکَرِیمِ ﴿۶﴾ الَّذِی خَلَقَکَ فَسَوَّاکَ فَعَدَلَکَ ﴿۷﴾ فِی أَیِّ صُورَةٍ مَّا شَاء رَکَّبَکَ ﴿۸﴾  

ای انسان چه شد که به خدای کریم و بزرگوار خود مغرور گشتی.آن خدایی که تو را از عدم بوجود آورد به صورت کامل و تمام بیاراست و سپس اعتدال بخشید-حال انکه به هر صورتی که خواستی خلق را توانستی کرد. 

سوری انفطار 6-8 

1-انسان آفریده می شود2-بعد از مدتی به اندازه های مساوی تقسیم می شود(واژه ی تعدیل)یعنی تقسیم کردن به عدل3-پس از مدتی از تقسیم به تعادل می رسد4-به توازن رسیدن آغاز به شکل گرفتن به شکلی که از پیش تعین شده بود می رسد. 

مرحله ی اول  

پس از رسیدن اسپرم به تخمک و ترکیب شدن آنها با هم سلول اولیه درست می شود.  

مرحله ی دوم 

پس از مدت کوتاهی پس از آفرینش اولین تقسیم سلولی  صورت می گیرد.ابتدا به دوقسمت سپس به چهار قسمت مساوی سپس به هشت قسمت مساوی سپس به شانزده و سی ودو قسمت مساوی تقسیم می شود. 

در مرحله ی سوم 

در اولین سلول مواد غذایی موجود در سیتوپلاسم بطور مساوی میان سی دو سلول بطور مساوی تقسیم می شود و نسبت مواد غذایی موجود در سیتو پلاسم مساوی می شود(با توجه به میزان نیاز هسته)و به تعادل می رسد. 

در مرحله ی چهارم انسان پس از تعادل یافتن آغاز به شکل گرفتن به شکلی که از پیش تعین شده می رسد. 

شکل و شمایل و خصوصیات جنین همانطور که در ایه مطرح می کند پیش از اینکه جنین شکل بگیرد.وجود داشته که بصورت کد DNA در هسته ی سلول ها وجود داشته است.

در آیات مختلفی از قرآن به تاریکی های سه گانه اشاره می شود.

در دوران جنینی در رحم مادر سه لایه تشکیل می شود که نتیجه تقسیم تخمک جنس ماده به سه لایه نازک است که به ترتیب شامل

پرده آمنیون  که شامل مایع زلالی به نام آمینوتیک است که جنین در آن شناور است را احاطه می کند.

پرده کریون که سلول های سطحی آن به غشای مخاطی رحم نفوظ کرده است و لایه سوم کیسه پرده است که که به عنوان دیواره جفت نیز نامیده می شود .

اما تعبیر صحیح آن شامل اکتودرم آندودرم و مزودرم است که به لایه های بیرونی درونی و میانی جنینی اشاره می شود.

در هفته سوم از رشد جنین لایه های جنینی اکتودرم مزودرم و آندودرم تشکیل می شوند

اکتودرم بافت های دستگاه عصبی مرکی نحیطی بافت پوششی حسی گوش بینی و چشم غده پستان مینای دندان و غده هیپوفیز را تشکیل می دهد.

مزودرم بافتهای پیوندی غزروف استخوان ماهیچه های مخطط و صاف سلولهای لنفاوی خونی و دیواره قلب و رگهای خونی و لنفاوی عده های جنسی و مجاری آنها طحال و قسمت قشری فوق کلیه را تشکیل می دهد.

آندودرم نیز دستگاه گوارش پوشش اپیتلیال مجاری تنفی پارانشیم تروئید پاراتیروئید کبد لوز المعده لوزه ها و تیموس و پوشش اگیتلیالی مثانه پیشابره صندوق صماخی و مجرای شنوایی را تشکیل می دهد.

در سوره زمر آیه 6 نوشته شده است

شما را از نفسى واحد آفرید سپس جفتش را از آن قرار داد و براى شما از دامها هشت قسم پدید آورد شما را در شکمهاى مادرانتان آفرینشى پس از آفرینشى [دیگر] در تاریکیهاى سه گانه  خلق کرد این است‏خدا پروردگار شما فرمانروایى [و حکومت مطلق] از آن اوست‏خدایى جز او نیست پس چگونه [و کجا از حق] برگردانیده مى‏شوید

در زمان نزول قرآن دستگاه رادیولوژِ وجود نداشت که این سه لایه شناسایی شوند.

فیلم سخنان دکتر فریدون صحافی در باره جنین شناسی در قرآن